据厦门边检总站高崎站介绍,本次首航以包机形式进行,首班由台南抵达厦门的航班旅客以台商和从台湾探亲归来的大陆居民为主。赴台旅游团、个人游旅客则是首架赴台南包机的主要客源,其中大陆赴台游团队4个101人,个人游旅客22人,赴台游客占整个航班旅客人数的80%以上,而剩余的旅客中,回台过中秋的台商占了多数。
厦门至台南航线的开通,将使两岸居民往来更加便利。据初步估计,厦门与台南直航之后,厦门至台南的时间可以节省两个小时以上,而且直航可以省去中间的行李托运。